TMT磷酸化蛋白质组学是一种基于TMT（Tandem Mass Tag）定量标记技术的高通量磷酸化蛋白质研究方法，主要用于研究蛋白质磷酸化修饰的动态变化及其在细胞信号传导、疾病发生和药物作用中的调控机制。蛋白质磷酸化是翻译后修饰之一，广泛参与细胞周期调控、代谢调节、免疫应答等生物过程。TMT技术结合磷酸化修饰富集策略和高分辨率质谱分析，使得研究者能够在多个样本间进行精准的磷酸化蛋白定量分析，并挖掘关键的磷酸化调控网络。TMT磷酸化蛋白质组学在癌症、神经退行性疾病、心血管疾病及新型药物开发等研究中具有广泛应用，为揭示疾病发生机制和寻找潜在的药物靶点提供了数据支持。TMT磷酸化蛋白质组学的主要优势体现在其高通量、高精度和良好的数据可重复性。相比于传统的磷酸化蛋白质组学研究方法，TMT技术能够在一次实验中同时分析多个样本，显著提高实验效率，并减少实验间的批次效应。此外，TMT标记在肽段水平上进行，使得定量数据更加稳定可靠。但是该技术也存在一定的挑战，例如，共流干扰（co-isolation interference）可能影响定量精度，特别是在磷酸化修饰检测中，因磷酸基团的不稳定性可能导致部分肽段的信号损失。

TMT磷酸化蛋白质组学的实验流程涵盖多个关键步骤，包括样本制备、TMT标记、磷酸化肽段富集、液相色谱分离、质谱分析和数据处理。首先，从组织、细胞或生物体液中提取总蛋白并通过胰蛋白酶等酶切割成多肽混合物。随后，利用TMT标签对不同实验组的肽段进行化学标记，确保在后续质谱分析中能够区分不同样本的来源。由于磷酸化修饰通常以低丰度形式存在，需要采用磷酸化特异性富集策略，如金属氧化物亲和色谱（IMAC）、二氧化钛（TiO₂）微球富集等方法，提高磷酸化肽段的检测灵敏度。接着，富集后的磷酸化肽段通过高效液相色谱（HPLC）进行分级分离，降低样本复杂度，并进入高分辨率质谱仪（如Orbitrap、Q-TOF）进行深度分析。在质谱的MS2或MS3阶段，TMT标签释放出特定质量的报告离子信号，研究者可通过这些信号计算各个样本中的磷酸化肽段相对丰度，从而获得全局性的磷酸化蛋白定量信息。最终，利用生物信息学工具（如Proteome Discoverer、MaxQuant等）进行蛋白质鉴定、磷酸化位点解析及功能富集分析，以揭示潜在的信号通路和调控机制。

TMT磷酸化蛋白质组学的数据分析涉及多个关键环节，包括磷酸化蛋白鉴定、定量计算、差异磷酸化分析、信号通路富集及网络构建。研究者首先利用数据库搜索算法（如Sequest、Mascot）鉴定磷酸化蛋白及其修饰位点，并通过统计学方法筛选在不同实验组间发生显著变化的磷酸化肽段。这些差异磷酸化位点通常对应于关键的信号通路节点，如MAPK、PI3K-Akt、JAK-STAT等信号通路，它们在细胞增殖、分化、代谢调控等过程中发挥核心作用。此外，利用KEGG、GO等数据库进行功能富集分析，可以揭示磷酸化蛋白在特定生物学过程中可能的作用。

随着技术的进步，TMT磷酸化蛋白质组学正朝着更高灵敏度、更高覆盖度和更低背景噪音的方向发展。例如，改进的磷酸化富集方法，如MOAC-Ti4+、聚多巴胺涂层磁性微球等，显著提高了低丰度磷酸化肽段的检测效率。

百泰派克生物科技依托先进的质谱平台和深厚的蛋白质组学研究经验，提供高质量的磷酸化蛋白质组学分析服务。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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